Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Rnf25Q9QZR0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf25Q9QZR0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf25Q9QZR0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf25Q9QZR0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms