Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms