Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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