Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms