Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Csnk1eQ9JMK2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms