Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms