Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms