Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dclk1Q9JLM8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms