Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Tmod4Q9JLH8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmod4Q9JLH8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmod4Q9JLH8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Tmod4Q9JLH8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod4Q9JLH8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms