Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Habp4Q9JKS5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms