Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms