Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scamp5Q9JKD3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms