Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ap4m1Q9JKC7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap4m1Q9JKC7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms