Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms