Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl1Q9JI74 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klhl1Q9JI74 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Klhl1Q9JI74 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms