Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pgpep1Q9ESW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pgpep1Q9ESW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms