Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim2Q9ESN6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim2Q9ESN6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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