Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp29Q9ES63 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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