Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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