Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Erg28Q9ERY9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Erg28Q9ERY9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Erg28Q9ERY9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Erg28Q9ERY9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Erg28Q9ERY9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Erg28Q9ERY9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms