Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cse1lQ9ERK4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms