Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms