Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn12Q9ER56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms