Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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