Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r29Q9EQ41 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r29Q9EQ41 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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