Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r56Q9EPS9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r56Q9EPS9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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