Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms