Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf6Q9DBU5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf6Q9DBU5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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