Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms