Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmtr1Q9DBC3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmtr1Q9DBC3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms