Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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