Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mcts1Q9DB27 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mcts1Q9DB27 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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