Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgf29Q9DA08 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgf29Q9DA08 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms