Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms