Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms