Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx5Q9D8U8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx5Q9D8U8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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