Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c6Q9D8P7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c6Q9D8P7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c6Q9D8P7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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