Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms