Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Jam3Q9D8B7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Jam3Q9D8B7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms