Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms