Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slx4ipQ9D7Y9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slx4ipQ9D7Y9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms