Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns2Q9D7J7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms