Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nop56Q9D6Z1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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