Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms