Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfn4Q9D6I3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms