Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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