Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms