Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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