Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Batf3Q9D275 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Batf3Q9D275 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms