Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms